Personnellement, je préfère colorer ma pâte dans la masse. Après, ce n'est plus colorer mais peindre. Ceci dit, chaque technique a ses avantages. Quand tu peins après, tu peux apporter des effets, des dégradés, des ombres. Mais selon la couleur utilisée, gaffe aux coups de pinceau, à une couleur trop diluée ou trop épaisse. Et quand tu colores dans la masse, il faut compter que la couleur fonce. Donc tu ne sais jamais à l'avance comment elle sera après, à moins que de faire une mini boulette et de la laisser sécher pour voir.
Si tu peins après par contre, il y aura des endroits rendus difficilement accessibles au pinceau (dessous d'un bras par ex.). Imagine un personnage tenant une peluche dans ses mains ; bonjour pour peindre le corps derrière la peluche ! Voilà. A toi de choisir suivant ce que tu veux obtenir.